A visita de Bento XVI a Lisboa, Fátima e Porto acarreta máxima segurança. Ao todo, nas três cidades que Bento XVI visita, o corpo de protecção civil é composto por 1747 operacionais, 491 veículos de socorro e apoio e 57 meios especiais, além de cinco viaturas de Emergência Médica (INEM), com uma equipa de profissionais a acompanhar permanentemente Bento XVI, e cinco postos de socorro da Cruz Vermelha Portuguesa.
O policiamento da visita do Papa no Porto está a cargo da PSP. Contudo, a segurança pessoal de Bento XVI cabe à Guarda Suíça.
O Rio Douro vai ser fiscalizado pela Marinha, que mobilizou mais de 200 elementos e navios de guerra.
O transporte aéreo do Papa, feito em helicópteros, está a cargo da Força Aérea Portuguesa.
Também o Corpo Nacional de Escutas vai mobilizar-se na visita do Papa ao Porto. Trezentos escuteiros vão dar apoio à comunhão durante a celebração para os serviços de acolhimento, logística e informações às pessoas.